牡丹江开发区成立于2006年1月,是由原牡丹江江南新城区开发区建设管理委员会、牡丹江对俄贸易工业园区、循环经济园区三区整合而成,全称为牡丹江对俄经济技术开发区,同时挂江南新城区和国家级循环经济试点园区的牌子。1992年,牡丹江市拉开了开发区建设的序幕,牡丹江市经济技术开发区经省政府批准成立;2002年成立牡丹江市江南新城区开发建设管委会;2004年全省清理整顿开发区,牡丹江经济技术开发区获准保留,当年又在此基础上市政府批准成立牡丹江市对俄贸易工业园区;2005年经国家发改委等七部委批准设立牡丹江国家级循环经济试点园区;2006年经省政府批准成立省级牡丹江高新技术产业开发区;同年,经市委、市政府批准,将牡丹江江南新城区、牡丹江经济技术开发区、国家级循环经济试点园区整合为牡丹江开发区,对外称牡丹江对俄经济开发区;2011年省编委批准牡丹江市级园区整合成立牡丹江经济开发区管委会;2013年2月,国务院批准牡丹江经济开发区晋升为国家级开发区。牡丹江经济开发区是牡丹江市抢抓国家实施振兴东北老工业基地战略、对俄经贸科技合作战略升级、建设哈牡绥东对俄经济产业带和陆海联运大通道建设等历史性机遇上拓建而成,旨在通过开发区的建设,进一步拓展牡丹江城市发展空间,增强地区性经济辐射和拉动功能,推进新型工业化和城乡统筹进程,促进牡丹江经济社会追赶型、跨越式发展。